På Natural Sciences afsluttes enhver kandidatuddannelse med et speciale, hvor der er mulighed for at lave såkaldt erhvervsspeciale i samarbejde med en virksomhed eller organisation. Et erhvervsspeciale giver den studerende mulighed for, at afprøve akademiske færdigheder uden for universitetet, samt skabe relationer til arbejdsmarkedet. 

Erhvervsspecialer kan både etableres på initiativ fra den studerende eller via AU’s job- og projektbank, hvor virksomheder kan promovere og søge kandidater til erhvervsspecialer. 

Ved et erhvervsspeciale bliver den studerende tilknyttet en vejleder fra universitetet, der samtidig fungerer som eksaminator. Der skal desuden tilknyttes en projektvejleder ved den virksomhed/institution, hvor specialet skrives. 

Den studerende, vejlederen og virksomheden udfærdiger sammen en kontrakt for specialet, der bl.a. indeholder information om formål, emneafgrænsning, vejlednings- og projektplan, ressourcemæssige forpligtelser og deadlines. En kontrakt bliver lavet via fakultetets kontraktgenerator og underskrives af den studerende, virksomheden og vejlederen, inden den godkendes af den uddannelsesansvarlige. 

Erhvervsspecialer bedømmes på samme måde som almindelige specialer, med brug af eksterne censur.